meta分析中如何用R进行发生率的合并
在R中进行发生率的合并分析(meta-analysis)通常可以使用meta
、metafor
或dplyr
等包。以下是一个使用metafor
包进行发生率合并的基本步骤:
如果你还没有安装metafor
包,可以使用以下命令进行安装:
install.packages("metafor")
然后加载该包:
library(metafor)
假设你有多个研究的发生率数据,包括每个研究的事件数和总样本数。你可以将这些数据存储在一个数据框中。例如:
# 创建一个数据框
data <- data.frame(
study = c("Study 1", "Study 2", "Study 3"),
events = c(30, 50, 20), # 事件数
n = c(100, 200, 150) # 总样本数
)
接下来,计算每个研究的发生率和标准误:
data$event_rate <- data$events / data$n
data$se <- sqrt((data$event_rate * (1 - data$event_rate)) / data$n)
使用rma
函数进行随机效应模型的Meta分析:
res <- rma(yi = event_rate, sei = se, data = data, method = "REML")
你可以使用summary
函数查看Meta分析的结果:
summary(res)
可以使用forest
函数绘制森林图,以可视化合并结果:
forest(res)
你可以检查异质性,例如使用Q检验和I²统计量:
res$QE # Q检验
res$I2 # I²统计量
以下是完整的示例代码:
# 安装和加载metafor包
install.packages("metafor")
library(metafor)
# 创建数据框
data <- data.frame(
study = c("Study 1", "Study 2", "Study 3"),
events = c(30, 50, 20),
n = c(100, 200, 150)
)
# 计算发生率和标准误
data$event_rate <- data$events / data$n
data$se <- sqrt((data$event_rate * (1 - data$event_rate)) / data$n)
# 进行Meta分析
res <- rma(yi = event_rate, sei = se, data = data, method = "REML")
# 查看结果
summary(res)
# 绘制森林图
forest(res)
# 检查异质性
res$QE
res$I2
以上步骤可以帮助你在R中进行发生率的合并分析。如果你有特定的数据或需求,可以根据实际情况进行调整。